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兩種處在不同上皮–間質轉化狀態之台灣口腔癌細胞株所誘導的不同腫瘤基質成分探討

為了解決Hunter mar ig的問題，作者劉奕宏 這樣論述：

上皮–間質轉化 (epithelial–mesenchymal transition, EMT) 是一個上皮細胞獲取間質特性的細胞層次生理機轉，常發生於胚胎形成、器官發展、腫瘤侵犯及轉移等過程。歷經完全EMT而獲有間質特徵的癌細胞咸被認為較具幹細胞特性及抗藥性。此外，包括美國頭頸癌基因組圖譜 (TCGA-HNSC) 在內的多類癌症組織中，均可檢測到一種位於腫瘤組織侵襲前緣的獨特病理特徵，稱為partial EMT (p-EMT)。與進行單獨侵犯的EMT 癌細胞相比，集體移動的p-EMT 細胞尚需來自腫瘤微環境中其它成員的協助，如移動時軌道的清除、細胞外基質 (ECM) 重塑、逃避免疫系統攻擊

等複雜且動態性之交互作用，方能於腫瘤基質 (stroma) 中做定向集體的移動，完成類似血管淋巴侵犯 (angiolymphatic invasion) 或神經周圍侵犯 (perineural invasion) 等不良預後病理現象。為了深入探討口腔癌細胞進行侵襲時與微環境中各成員間的分子互動機轉，本論文針對具有 EMT (OC3) 及 p-EMT (TW2.6) 特性的口腔癌細胞株之十一例異種移植組織 (cell line derived xenograft, CDX) 進行轉錄體定序分析，清楚剖繪每一例 CDX 其源自口腔癌細胞及老鼠基質成分之基因表現情形，最後以免疫組織化學染色 (imm

unohistochemistry) 驗證生物資訊分析結果。我們發現與EMT 組別相比，p-EMT 腫瘤在小鼠體內生長得較快、腫瘤組織中偵測得到較豐富的宿主血管密度、巨噬細胞多聚集於腫瘤邊緣、以及測得較多的透明質酸沈積 (hyaluronan deposition)。此外，發炎性癌症相關成纖維細胞 (iCAF) 的特徵基因多富集於p-EMT 的異種組織基質中; 肌性癌症相關成纖維細胞 (myCAF) 的特徵基因則富集於EMT的組別裏。重要的是，異種組織基質基因的表現多能於人類口腔癌組織單細胞轉錄體數據庫 (scRNA-seq, GSE103322) 中得到驗證，包括肌成纖維細胞 (myofib

roblast) 的IL6、ACTA2、MYL9、TAGLN; 肌性癌症相關成纖維細胞的TGFBI、TGFB2、FN1、THY1、COL12A1、FAP、HAS1、HAS2; 發炎性癌症相關成纖維細胞的FAP、CXCL12、GSN; 內皮細胞的 PECAM1、TGFBR2、HYAL1、HYAL2。為了進一步探討EMT 與 p-EMT CDX 組織中之基質基因表現是否具臨床相關性，我們以一組參數完整的40例台灣口腔癌組織微陣列數據庫，針對20個基質基因表現與病人的總生存率進行Cox 比例風險模型評估。結果顯示其中6個基因在單變量分析中具統計顯著意義，包括TGFBI (HR 11, 95% CI

2.4–50, p=0.0021)、TGFB2、COL12A1、IL6、HAS2 和 HYAL1 (HR 0.15, 95% CI 0.042–0.55, p = 0.0039)。進一步多變量分析則闡明TGFBI及HYAL1的表現於該40例嚼食檳榔相關的台灣口腔癌組織中，分別為獨立的不良和具保護性生物標記。我們以同樣的方式針對美國TCGA 33種癌症組織，評估其基質基因表現對病人總生存率之Cox比例風險模型結果，發現TGFBI對於包括頭頸癌在內的七種癌症都是一個較差的指標 (BLCA, invasive BRCA, CESC, GBM, HNSC, KIRC, UVM)，而HYAL1則是其中四

型癌症的良好指標 (KIRC, KIRP, Pheochromocytoma, UVM)。因此我們的結果強烈支持不同癌症類型中應存在共同基質效應的理論。綜合以上所述，本論文除揭示數個台灣口腔癌組織的新靶點，也提供了可行的臨床應用: 例如由術後檢體或復發活檢體 (biopsy) 組織中，進行TGFBI單一基因之免疫組織化學染色，依其結果提供兼顧存活風險及避免過度治療之臨床決策。

以埃爾頓棲位方法探討藻礁區兇猛酋婦蟹的生態角色及高密度的成因

為了解決Hunter mar ig的問題，作者李坤璋 這樣論述：

藻礁是由殼狀珊瑚藻所建構成的生物礁。臺灣桃園海岸的藻礁首次被發現於1986年，礁體的長度約有27公里，是亞熱帶最大的潮間帶藻礁生態系。藻礁形成的過程，在礁體內形成了許多孔隙，使其環境適合許多生物棲息。然而在尚未了解藻礁生態系的價值前，藻礁就已面臨了許多環境破壞的壓力。因此本研究透過調查藻礁生態系的螃蟹組成，找出可能的指標蟹類監測環境的變化。本研究總共有四個部分，第一個部分是了解藻礁生態系的螃蟹組成。我們共發現52種螃蟹，在大潭G2的礁體上有最高的螃蟹物種數及密度。進一步選擇密度最高的兇猛酋婦蟹 (Eriphia ferox) 進行指標物種的可能性評估。第二及第三部分是調查兇猛酋婦蟹在藻礁生態

系的角色，以及食物量是否會影響其密度。研究結果發現兇猛酋婦蟹是一種雜食動物，它的營養位階和頂級掠食者相當，同時也發現在食物資源豐富的棲地中，兇猛酋婦蟹的族群密度較高且同位素棲位 (Isotopic niche) 較小。這樣的發現顯示當食物資源較豐富時，螃蟹會花比較多時間在覓食且疏於維護自己的領域，因其領域變小，整個區域的螃蟹密度上升。第四個部分是討論影響兇猛酋婦蟹分布的可能原因。在臺灣兇猛酋婦蟹和光手酋婦蟹 (Eriphia sebana) 有相似的形態及外觀，但兇猛酋婦蟹只分布在北部，而光手酋婦蟹分布在南部。我們發現這兩個物種的食性相似。在共域時，兩物種的同位素棲位重疊，表示物種間的食物資源

分化較少。因此物種間的競爭可能是造成目前分布的可能原因。總括來說，本研究在藻礁生態系中記錄了最詳盡的螃蟹物種組成。同時發現兇猛酋婦蟹的同位素棲位寬度會隨著食物資源變動，使其有作為指標物種反映藻礁生態系食物資源變動的潛力。